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本研究旨在对合作猪血红素加氧酶1(Heme oxygenase 1,HMOX1)基因克隆及生物信息学分析。本试验以NCBI数据库中已知的野猪HMOX1基因m RNA序列为模板设计特异性引物,应用RT-PCR技术扩增得到CDS区全长序列,采用生物信息学分析软件对合作猪HMOX1基因序列特征、同源性以及编码产物的理化性质、二级结构和三级结构、亚细胞定位、潜在信号肽剪切位点、跨膜结构域、亲疏水性、保守结构域、激酶磷酸化修饰位点进行预测分析。结果表明,合作猪HMOX1基因CDS全长867 bp,编码288个氨基酸,与NCBI中公布的野猪(NM＿001004027.1)HMOX1基因核苷酸同源性为99%,氨基酸同源性为99.3%,并发现在第450 bp处T>C为同义突变;第706 bp处A>G和第802 bp处A>G为错义突变,导致第236位和第268位的异亮氨酸均突变为缬氨酸。合作猪与野猪、绵羊、牛、犬、兔、人、猫、马、小鼠、大鼠和鸡的氨基酸同源性分别为99.3%、86.5%、85.5%、84.7%、84.0%、82.6%、82.6%、81.4%、78.9%、77.2%和61.5%;系统进化树分析发现合作猪与野猪亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远。合作猪该基因编码产物具有亲水性和不稳定性,二级结构以α-螺旋为主,主要定位于分泌系统囊泡,不存在信号肽剪切位点,属非分泌蛋白;存在一段跨膜螺旋结构,含有一个Heme＿oxygenase保守结构域,44个磷酸化修饰位点。本研究成功克隆合作猪HMOX1基因CDS全长序列,可为今后HMOX1基因在合作猪高海拔低氧胁迫下的适应性分子机制研究提供科学理论依据。