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沅水入洞庭湖口河湖相连，河网交织，水系紊乱，水情极为复杂。因历年来频繁挽垸建障，加上现今对湖口湿地的无序和过度开发、周边工农业生产污染以及三峡蓄水工程建设等因素的影响．导致沅水入湖口三角洲发育迅速，湿地珍稀植物及鸟类、鱼类等动、植物资源种群数量迅速减少，生物多样性衰退趋势十分明显，湿地功能退化。应加强流域综合治理、实行江湖同治，加大退田还湖力度、疏浚天然河道、恢复入湖口河流故道，加强入湖口自然保护区的建设和管理，以逐步恢复其湿地功能。