【摘 要】
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目的 探讨用表面增强激光解吸/离子化-飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术建立尿液树形蛋白
【机 构】
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上海交通大学附属第六人民医院泌尿科,张元芳
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目的 探讨用表面增强激光解吸/离子化-飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术建立尿液树形蛋白质谱模型,鉴别膀胱移行细胞癌.方法 膀胱肿瘤组61例,均为移行细胞癌;对照组95例,其中正常人53例,非膀胱癌其他泌尿系疾病患者42例.以上随机分为训练组118例,测试组38例.用IMAC-Cu-3芯片检测各尿液标本,并绘制蛋白质谱谱图.结果 将膀胱肿瘤组与对照组尿液标本结果相比较,用ProteinChip Software 3.0软件筛选出差异表达蛋白质.Biomarker Pattern Software分类决策树软件对118例训练样本进行分析,并建立树形蛋白质谱模型,最终以3896 m/z、4977 m/z、9638 m/z、15 103m/z和15 509 m/z作为判断依据,分出6个最终节点;其筛选膀胱肿瘤的敏感度和特异度分别达到84.8%和91.7%.以38例测试组样本为盲法测试,敏感度和特异度分别达到93.3%和87.0%.结论 利用SELDI-TOF-MS蛋白质技术结合决策树生物信息学分析方法,建立了较为满意的鉴别膀胱癌的尿液树型蛋白质谱模型,为膀胱癌的无创诊断提供了一条新的途径和方法.
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