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目的
探讨1例蛋白C错义突变(Met406Ile)导致静脉血栓栓塞症的遗传表型和蛋白结构变化。
方法对1例遗传性蛋白C缺陷症家系进行家系调查。采用发色底物法检测家系成员蛋白C活性。抽提外周血基因组DNA,聚合聚合酶链反应(PCR)扩增PROC基因9个外显子,利用直接测序法进行基因序列分析。针对先证者突变位点,对其家系成员进行相应位点DNA测序。利用同源模建技术重建突变体PC三维空间构象,分析突变对其三维空间结构的影响。
结果先证者及4位家系成员蛋白C活性不同程度下降,分别为29.7%,42.2%,42.4%,67.3%和70.7%。其中先证者与3位家系成员携带相同突变类型(c.1218G>A,Met406Ile)。另1家系成员携带PROC基因多态性(rs1799810)。同源模建显示:Met406Ile突变导致氨基酸残基间VDW作用半径减小,其中Gly418:C与Ile406CG2,Gly418:C与Ile406 HG23,Leu419:N与Ile406:HG23间距离分别减少至2.0733å、1.620 45å和1.446 52å。突变后PC蛋白能量由-8.504 54 kcal/mol增加至1210.04 kal/mol,范德华相互作用能变化显著。
结论该PC突变家系的9号外显子c.1218G>A导致Met406Ile错义突变,突变后局部氨基酸互相碰撞,影响PC蛋白空间结构的稳定性。