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目的 为了解云南省西南地区福寿螺的种群结构,对当地福寿螺的细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome c oxidase subunitⅠ,COⅠ)基因序列进行单核苷酸多态性分析。方法 2016年11月18日至2017年5月8日,于云南省西双版纳州景洪市和勐腊县、普洱市思茅区和西盟县、临沧市耿马县及德宏州瑞丽市6个调查点采集福寿螺,进行形态学观察。提取福寿螺基因组DNA,PCR扩增COⅠ基因,对将阳性PCR产物进行测序。采用Mega6.06软件进行序列特征分析、计算遗传距离。采用邻位相连法构建系统发育树。结果 共采集福寿螺样本200份,无法通过形态学鉴定进行种类区分。PCR扩增获得129条COⅠ基因序列(小管福寿螺Pomacea canaliculata 123条,孤岛福寿螺P.insularum 6条),经多序列比对排齐后长度为621 bp,存在76个核苷酸变异位点,76个简约信息位点,无单一变异、插入和缺失位点、无碱基转换和颠换,A、G、T、C的平均含量分别为23.1%、20.5%、39.8%和16.7%;编码的207个氨基酸残基中,保守氨基酸有203个(占98.1%)。COⅠ基因序列分属4个单倍型(HAP)——HAP-1、HAP-2、HAP-3和HAP-4。HAP-1频率最高,占71.3%(92/129),其次是HAP-3,占17.8%(23/129),HAP-2和HAP-4频率分别为6.2%(8/129)和4.7%(6/129)。HAP-1、HAP-2和HAP-3与小管福寿螺的遗传距离最短,为0～0.052,碱基差异数为0或31个;与球螺属(Pila conica)的遗传距离最长,为0.214～0.239,碱基差异数为115～126个。HAP-4与小管福寿螺、孤岛福寿螺和球螺属遗传距离分别为0.100、0.060和0.223,碱基差异数为57、35和119个。4个单倍型间的遗传距离为0.021～0.100,碱基差异数为13～57个。其中,HAP-1和HAP-2的遗传距离最近,为0.021;HAP-4与HAP-1、HAP-2和HAP-3的遗传距离最远,为0.100; HAP-3与HAP-1和HAP-2的遗传距离处于中间水平,为0.052。HAP-1、HAP-2和HAP-3与小管福寿螺基因序列(GenBank登录号为AB433769、KT313034、EU523129)的一致性为98%～100%;HAP-4与孤岛福寿螺基因序列(GenBank登录号为EF514942)的一致性为99%。结论 云南省西南地区存在小管福寿螺和孤岛福寿螺2个种类,且小管福寿螺已产生一定的遗传分化。