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目的：测算和分析中国1990年、2000年和2010年政府卫生支出的健康效率及其影响因素。方法：运用DEA和Tobit测算政府卫生支出的健康效率,评估效率值的影响因素。结果：政府卫生支出的健康生产效率在波动中有所提高,不同年度处于前沿面的省份基本一致,远离前沿面的省份存在较大差别;该效率在各区域间的差异较显著,东部地区政府卫生支出的健康生产效率高于中、西部地区;财政分权与政府卫生支出健康效率存在显著负相关关系。结论：财政分权制度的改革与完善是提高政府卫生支出健康效率的重要途径。