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猪圆环病毒Ⅱ型（PCV2）是引起临床断奶仔猪多系统衰竭综合症（PMWS）的主要病原之一，而与之遗传相关的猪圆环病毒Ⅰ型（PCVI）无致病性。本研究从病猪的脾脏通过PCR扩增并成功克隆了PCV1的全基因组，在此基础上，对GenBank中发表的所有31株PCV1以及部分PCV2（60株）进行了生物信息学分析。PCV1株间遗传与分子进化分析结果表明：PCV1可分为基因Ⅰ型与基因Ⅱ型两种基因型。PCV1与PCV2之间基因组结构和功能区分析结果表明：PCV1和PCV2基因组之间在复制起始区等功能区高度保守，在主要的