【摘 要】
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统计分析了爱滋病病毒全序列中中间间隔S从0到100、侧翼序列长度L从4开始的所有回文结构,通过分析不同S、L的回文结构的频数以及AT含量,发现回文结构的AT含量普遍高于全序列
【机 构】
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内蒙古大学理工学院物理系,内蒙古师范大学物理与电子信息学院
【基金项目】
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国家自然科学基金（30660044）和高等学校博士点基金（20050126003）资助项目
论文部分内容阅读
统计分析了爱滋病病毒全序列中中间间隔S从0到100、侧翼序列长度L从4开始的所有回文结构,通过分析不同S、L的回文结构的频数以及AT含量,发现回文结构的AT含量普遍高于全序列的AT含量.有三种辅助蛋白（Vif、Vpu、Nef）存在于病毒颗粒内,我们找出编码这三种蛋白的DNA序列,并统计出它们的回文结构,分析它们的AT含量及回文数密度（平均每1000个碱基中包含的回文数）,并与丙型肝炎病毒序列回文结构进行对比.发现编码Vpu（HIV-1特有的蛋白）蛋白序列的回文结构在AT含量,和回文数密度方面均显示其特性.
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