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捕捞配额制度是指渔民从渔业行政管理机关取得捕捞配额，在配额范围内从事捕捞。我国捕捞限额制实现的法律前提是捕捞权可以流转，因此，政府应当建立相关权利流转平台，实行登记生效主义。在实际设定捕捞总量的时候，渔业行政主管部门必须根据不同的渔区，考虑多方面因素设定。在分配总额时，要区分商业渔业与生计渔业，切实考虑传统渔民的利益，同时，也要考虑配额的有效期限，防止垄断等一系列问题，确保我国捕捞业的健康持续发展。