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利用玉米B73全基因组53 764个基因的表达序列数据,使用多重变量分析软件CodonW对影响密码子用法的因素进行分析。结果表明：在59种同义密码子中有27种为玉米最优密码子。同时还指出,最优密码子的使用频率（FOP）与基因的G＋C含量（GC）,尤其是第3位密码子的G＋C百分含量（GC3S）、密码子适应指数（CAI）和密码子偏爱指数（CBI）之间均呈现极显著的正相关（相关系数分别为r=0.780 7、0.822 3、0.731 4和0.986 3）,而与有效等位基因数ENc存在显著负相关（相关系数r=-0