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[目的]了解北京市疾病预防系统基础设施现状。[方法]普查北京市各区县疾病预防控制中心基础设施资料,运用EXCEL 2000进行数据统计分析。[结果]城八区疾病预防系统基础设施显著优于郊区县,各区县疾病预防控制机构房屋在建筑质量和面积上只有少数能达到标准要求。[结论]北京市各区县实验室建筑面积、实验室和保障用房比例普遍低于((疾病预防控制机构建设国家标准》,基础设施的配置缺乏规范和标准,已成为全市疾病预防控制系统建设中存在的主要障碍问题。