目的评价小肠镜和活体组织病理、超微病理检查对儿童慢性腹泻病的诊断价值。方法华中科技大学同济医学院附属同济医院儿科病房2005年2月至11月应用小肠镜和活体组织病理、超微病理检查明确诊断的3例慢性腹泻病患儿,对其临床表现、辅助检查、治疗方案及预后进行回顾性分析和总结。结果3例患儿均表现为长期反复腹泻。其中1例IgA水平异常增高、1例明显低蛋白血症。患儿均予小肠镜检,诊断分别为免疫增生性小肠病、原发性小肠淋巴管扩张症和异位内分泌性腹泻,2例病理、超微病理检查结果具有特异性。3例患儿均予营养支持治疗,1例四环素疗效明显,1例奥曲肽治疗有效,1例补液治疗即好转。结论小肠性慢性腹泻病诊治困难,小肠镜和活体组织病理、超微病理检查有助于提高儿童慢性腹泻病的诊治水平和深化对小肠疾病发病机制的认识。