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以23株来自全世界的CSFV的编码序列为试验研究对象，首先利用临界偶联法（neighbor-joining）做出23条序列的系统发生树．然后通过SimPlot程序分析找到疑似重组病毒的基因序列以及2条疑似亲本链，结果表明．CSFV39（AF07339）可能是强毒株Shimen和GXWZ02之间发生同源重组后的基因产物。