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RAPD标记是利用含有10(或9)个碱基的随机引物(单引物),通过聚合酶链式反应(PCR)对模板DNA进行随机扩增,比较不同基因组DNA的差异,RAPD标记具有样品用量少,灵敏度高,检测容易等优点,因而比RFLP更易于应用,但RAPD是显性标记,在分离群体中不能区别纯合显性和杂合显性个体。