盐胁迫下垂穗披碱草叶片转录组差异表达分析

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  摘要:为探究垂穗披碱草在盐胁迫下的分子响应机制,将200 mmol/L NaCl处理0、6、12、24、36 h的垂穗披碱草叶片进行转录组测序。结果表明,共获得转录本序列数量为462 235条,经过注释分析获得单基因序列数量229 597条,这些差异基因涉及氨基酸的合成和代谢、淀粉和蔗糖代谢、类黄酮生物合成、碳代谢和植物激素信号传导等途径,可作为研究垂穗披碱草盐胁迫响应主要研究机制。荧光定量PCR(qRT-PCR)验证表明,挑选的7个差异表达基因的表达趋势与测序结果相一致,说明测序结果准确可靠。本研究测序结果为垂穗披碱草的基因功能分析、分子标记开发和遗传多样性研究提供了理论参考。
  关键词:垂穗披碱草;盐胁迫;转录组;基因差异表达
  中图分类号: S184
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