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中医药信息学要获得创新发展,必须重视学科的理论科学发展。中医药信息学在理论科学领域中主要开展了4个方面的研究:非线性科学对中医药科学发展的影响;大数据理念对中医药信息学发展的影响以及中医药信息与数据所具有的特点;探讨在虚拟世界中重现意象世界的可能性及其所具有的理论意义;中医药信息学的原理与方法学。