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对高技术产业技术创新效率进行评价，有利于提高创新资源的利用率，有利于明晰创新能力培育的作用点。运用DEA—Malmquist指数方法对河南高技术产业四大类行业2003-2008年的技术创新效率进行实证分析，结果表明，河南高技术产业四大类行业的技术创新效率均为非有效。其中，医药制造业与航空航天器制造业技术效率低下且存在技术衰退问题，电子及通讯设备制造业存在技术衰退问题，医疗设备制造业技术效率低下。要解决河南高技术产业技术创新效率不足的问题，必须从提高技术效率与促进技术进步两个方面着手。