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转录水平的调控是基因表达最主要的调控方式，但是转录后水平的调控在基因表达过程中也起重要作用。mRNA的结构与基因表达转录后调控的关系包括S－D序列和基因的间隔区，5末端帽子结构与非翻译区，多聚（A）尾巴，3末端非翻译区及内含子序列对翻译的起始效率，mRNA的稳定性,基因表达的选择性与多样性等影响。