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利用ISSR分子标记技术对16个湖南柑橘主要品种进行了分子鉴定和亲缘关系分析。结果表明：9个引物共扩增出72条谱带，其中54条为多态性条带，多态率高达75％，平均每条引物扩增的DNA条带数目为8条。利用Popgene1．32程序进行了Nei遗传距离和遗传相似性分析，橙类中彭娜和纽荷尔的亲缘关系最近。UPGMA聚类分析结果表明，在遗传距离为0．76的水平上，16个柑橘品种可分为四大类群。