【摘 要】
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目的分析2001～2014年吉林省麻疹病毒核蛋白(nucleoprotein,N)基因变异情况。方法采用病毒分离、核酸提取及扩增、测序等方法获得麻疹病毒N蛋白基因序列,并通过Bio Edit、Mega
【机 构】
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吉林省疾病预防控制中心吉林省卫计委病毒重点实验室; 吉林省卫生监测检验中心;
【基金项目】
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吉林省卫生计生科研计划课题“吉林省十四年麻疹分子流行病学及病毒变异变迁研究”(2014Z031)
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目的分析2001～2014年吉林省麻疹病毒核蛋白(nucleoprotein,N)基因变异情况。方法采用病毒分离、核酸提取及扩增、测序等方法获得麻疹病毒N蛋白基因序列,并通过Bio Edit、Mega等生物信息学软件对所得序列进行变异分析。结果吉林省2005、2006、2009和2014年为麻疹高发年份;麻疹病毒流行株核苷酸变异率为0.59%～1.85%,氨基酸变异率为1.00%～2.67%,氨基酸的第100位点均出现L→I的突变,可能为吉林省特异性位点,2009年第82位点出现S→G的回复性突变,且一直延续至2014年,与第47和122位点的变异处于同一病毒株上,2013和2014年第63(R→I)、69(S→T)、77(R→L)和82位(R→I)点出现一致的突变;2009、2010年麻疹病毒株错义突变率最高;第47、82、122位点的氨基酸变异持续稳定流行多年,且其熵值最高。结论 2001～2014年吉林省麻疹病毒N蛋白基因的核苷酸和氨基酸变异率随年份的推移呈波动上升趋势,建议持续监测关键位点的氨基酸变异情况,结合流行病学资料对麻疹疫情的发展提供预测预警。
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