【摘 要】
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利用已经公布的粗糙脉孢菌基因组测序结果,对该真菌基因组中的微卫星(SSR)序列进行了系统分析.结果表明,在已经公布的38.0 Mb的基因组序列中,共有14 788个以1～6个核苷酸为基序
【机 构】
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云南省农业科学院生物技术研究所/农业部南方高原农业生物技术重点实验室,云南省农业科学院植物保护研究所
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利用已经公布的粗糙脉孢菌基因组测序结果,对该真菌基因组中的微卫星(SSR)序列进行了系统分析.结果表明,在已经公布的38.0 Mb的基因组序列中,共有14 788个以1～6个核苷酸为基序的SSR序列(长度大于15 bp,匹配值大于80%),其碱基总数占整个基因组碱基数的0.95%,平均2.57 kb就分布有一个大于15 bp的SSR.其中数量最多的三碱基SSR,数量达到4 7 2 9个,其次为六碱基SSR(2 940个)和单碱基SSR(2 489个),这3类SSR总数达10158个,占SSR总数的68.7
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