基于SNP芯片分析的蓝塘猪遗传群体结构

来源 :广东农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:backdoor6402415
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
为了保护和利用蓝塘猪种质资源,采用Illumina CAUPorince 50K SNP芯片对139头蓝塘猪进行遗传群体结构分析。结果显示,SNP芯片基因型分型的平均检出率高达98.24%,表明该芯片适合应用于中国地方猪。蓝塘猪的平均遗传距离值为0.3326±0.0339,主成分分析和G矩阵结果表明部分种猪之间亲缘关系较近。139头蓝塘猪种猪可以分成5个家系,分别为家系A、B、C、D和E,其中家系A、B、C和D均有种公猪。蓝塘猪的Y染色体共有两种单倍型,其中家系A和B属于单倍型A,家系C和D属于单倍型B。在蓝塘猪中共检测到1 680个ROH片段,10~20 Mb长度的ROH数量最多、占44.52%,平均每个蓝塘猪的ROH数量为12.09(±5.90)个,平均总长度为246.90(±170.93)Mb。通过SNP芯片,从遗传水平反映了一个蓝塘猪种群的群体结构,为地方猪种的保种、开发与利用提供了有力工具。
其他文献
近年来抽油机井杆管偏磨问题十分突出,抽油杆柱受力状况变坏,抽油杆在下行程时纵向压缩载荷增大,使得抽油杆柱失稳产生纵向弯曲的屈曲变形波数增加,因此抽油杆与油管偏磨加重
<正>浙政办发〔2012〕14号各市、县(市、区)人民政府,省政府直属各单位:为进一步健全政策性农业保险体系,扩大保险品种范围,增强农业抵御风险能力,促进农业现代化建设,根据《
期刊
采用4种冷冻稀释液制作白萨福克羊细管冻精,结果表明,解冻后的精子活率以Tris卵黄组解冻后精子活率最高,与其他3组相比差异极显著(P<0.01),其中对照组(柠檬酸钠糖类)为生产中
随着开采的延续,渤海区块部分老油田产量逐渐降低,为了盘活老井、提高老油田采收率,采用套管开窗侧钻技术。通过对渤中25-1油田的基本情况和E 3井的井身结构进行了调研,确定
国际21世纪教育委员会在向联合国教科文组织报告中,明确指出,“与学业失败问题为研究对象”是人类社会极其迫切的一项任务。促进每一个学生的全面、和谐发展是素质教育的追求
<正>浙政发〔2012〕33号各市、县(市、区)人民政府,省政府直属各单位:畜牧业是事关国家食物安全、民生改善和经济发展的重要基础产业。为切实保障生猪等主要畜产品有效供给,
期刊
冷轧带钢平整过程存在带材较薄,压下率较小等特点,应力状况较为复杂,采用传统模型对轧制力预报误差较大。采用神经网络模型对应力状态系数进行预报,可提高轧制力的预报精度。针对
<正>随着3G时代的到来,人们普遍认为,图像、视音频等多媒体服务将成为未来网络的主导业务,手机电视是其中之一。所谓手机电视就是利用手机看电视。在技术上有信号源、传播途
<正>浙政办发〔2012〕48号各市、县(市、区)人民政府,省政府直属各单位:省统计局、省发改委、省海洋与渔业局制定的《浙江海洋经济发展示范区建设统计监测办法(试行)》已经省
期刊
<正>浙政发〔2012〕22号各市、县(市、区)人民政府,省政府直属各单位:现将《浙江省食品安全&#39;十二五&#39;规划》印发给你们,请结合实际,认真贯彻实施。二○一二年三月二十
期刊