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方书的体例自秦汉时期确立以来不断发展完善，至两宋方书体例的创新达到一个高潮。《普济本事方》在方剂的基础上，增加了许叔微的临床医案及其"所得新意"，因此以"本事"为名。从《普济本事方》编撰伤寒内容的体例出发，以方剂、医案、医论3种要素的编排体例为研究对象，探讨其学术重点的表达与著作体例结构变化之间的内在关系。全书以方为纲，通过医案、医论对方剂进行解释说明，并勾连方剂之间的关系，扩展相关内容，将方、案、论合为一体，结合临床实际与理论分析，进一步解释、证明所载方剂的疗效，并结合历代方书体例的变迁，阐述案论结合佐证方剂有效性是方书类编撰体例的重要特征。