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为分析品种遗传多样性和遗传距离并构建品种聚类图和指纹图谱,该研究从DNA模板浓度、引物浓度、退火温度和循环次数等方面优化了叶子花ISSR-PCR反应体系和反应程序,利用11个ISSR引物对131个叶子花品种进行PCR扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测.结果表明:优化的ISSR-PCR反应体系中DNA模板浓度为0.5 ng·μL-1,引物浓度为0.5μmol·L-1,引物UBC813、UBC814、UBC815、UBC823、UBC824、UBC835、UBC840、UBC841、UBC843、UBC844和UBC876的最佳退火温度分别为52.3、55.9、54.3、54.3、53.6、56.2、56.2、51.9、54.4、54、50℃,循环次数为32.用11个ISSR引物对131个叶子花品种扩增出161条带,其中多态性条带156条,多态性比率为96.89％.单个引物的等位基因数、有效等位基因数、Nei's基因多样性指数和Shannon's信息指数分别为1.86～2.00、1.33～1.68、0.21～0.39和0.34～0.57,平均值分别为1.969、1.478、0.294和0.447.引物UBC841的鉴别率最高(80.92％),可有效鉴别106个品种,与引物UBC876结合可将131个叶子花品种完全鉴别开,建立了各品种的指纹图谱.叶子花品种的遗传距离范围为0.00～0.60,平均值为0.365,遗传多样性较低,在遗传距离0.58处,131个品种分为6大类群,聚类分析显示同一个种的品种大多聚在一类,但同一个种仍有品种未聚在一类或亚类、也有多个种的品种聚在一类.该研究较为准确地揭示了叶子花种质资源的遗传多样性,建立的指纹图谱为叶子花品种登记、知识产权保护以及品种鉴定提供了可靠技术和有效手段.