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科技型中小企业技术创新基金实施运行过程中存在着资助总额不足、对各区域的扶持力度不均、实际执行过程中信息不对称、扶持期限短、审核周期长、实际拨款滞后等不利因素,限制了技术创新基金的长远发展。其完善对策是:继续加大财政资金的投入,扩大基金政策的受益面;坚持以市场为导向,推动科技型中小企业与资本市场的有效对接;适当降低基金资助门槛;调整技术创新基金的扶持模式;缩短创新基金项目的审核周期;完善监督管理工作,规范基金运作流程;技术创新基金服务机构要提高服务质量。