白桦(Betula platypylla×B.pendula)BpEIL1基因克隆及生物信息学分析

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EIN3/EILs是乙烯信号转导过程中的重要转录因子,在植物抗逆及不同激素协同和拮抗反应中具有重要作用.本研究通过RT-PCR方法扩增得到白桦BpEIL1基因序列,并利用生物信息学方法对获得的序列进行结构及功能预测.结果 表明,白桦BpEIL1基因全长为2 968 bp,CDS为1 776 bp,编码的蛋白由591个氨基酸构成,属于EIN3超家族成员,是一个亲水性的不稳定蛋白.在白桦基因组中共找到2个EIN3超家族基因,与模式植物拟南芥和毛果杨EIN3超家族基因序列进行比较分析.结果 表明,白桦BpEIL1基因与拟南芥AtEIL3和毛果杨PtEIL3基因亲缘关系较近,而另一个基因则与毛果杨PtEIN3基因亲缘关系较近.本研究对白桦BpEIL1基因产物的特征进行了初步的分析,为该基因功能的进一步研究提供了参考.
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