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目的：建立Ⅲumina Miseq深度测序筛查酸奶中微生物的方法，分析酸奶中微生物的多样性。方法：以9种酸奶样品为研究对象，提取酸奶中细菌基因组DNA，应用高通量测序技术测定细菌的16SrDNAvl-v3变异区序列，得到9种样品中微生物群体分布和丰度、以及不同样品间的菌种差异与进化关系。结果：酸奶中微生物主要为厚壁菌门（Firmicutes），占据99．6％之高，其中厚壁菌门主要以链球菌属（Streptococcus、87．1％）、乳杆菌属（Lactobacillus、10．3％）、乳球菌属（Lactoc