【摘 要】
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目的 筛选肺癌骨转移患者血清外泌体中差异表达的mRNA,分析其作为肺癌骨转移标志物的诊断价值.方法 回顾性研究2016-01-01-2019-07-31上海交通大学附属第六人民医院肺癌骨转移患者临床资料,挑选3例肺癌患者发生骨转移前及骨转移后共6例自身对照样本进行高通量测序,采用基因本体论(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)对差异基因进行生物信息学分析.通过qPCR对同期本院168例肺癌患者血清外泌体样本中差异最显著的10个基因进行验证.采用受试者工作特征曲线(ROC)评估外泌体差异基因相对表达
【机 构】
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上海交通大学附属第六人民医院检验科,上海201306
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目的 筛选肺癌骨转移患者血清外泌体中差异表达的mRNA,分析其作为肺癌骨转移标志物的诊断价值.方法 回顾性研究2016-01-01-2019-07-31上海交通大学附属第六人民医院肺癌骨转移患者临床资料,挑选3例肺癌患者发生骨转移前及骨转移后共6例自身对照样本进行高通量测序,采用基因本体论(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)对差异基因进行生物信息学分析.通过qPCR对同期本院168例肺癌患者血清外泌体样本中差异最显著的10个基因进行验证.采用受试者工作特征曲线(ROC)评估外泌体差异基因相对表达量对肺癌骨转移的预测价值.结果 高通量测序结果发现461条差异表达基因.GO及KEGG分析结果显示,他们参与骨骼肌细胞分化、端粒酶活性的调节、TGF-β信号通路和丙戊酸盐代谢等多种骨转移相关的生物学进程.实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证结果发现,核因子-κB抑制因子α(NFKBIA)和亮氨酸拉链EF-hand结构域跨膜蛋白1(LETMD1)基因在肺癌骨转移组中表达上调,P＜0.05.ROC分析结果显示,NFKBIA和LETMD1曲线下面积(AUC)分别为0.788和0.708.进一步将2个差异基因与肺癌血清学诊断标志物CA125、Cyfra211联合分析,发现AUC进一步提高至0.822.结论 肺癌骨转移患者血清外泌体中NFKBIA和LETMD1显著高表达,检测血清外泌体NFKBIA和LETMD1表达水平对诊断肺癌骨转移有一定参考价值,可作为肺癌骨转移患者诊断的潜在参考指标.
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