大肠杆菌磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的克隆和表达

来源 :河北科技大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ajing819
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  摘要:为了更好地研究磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的結构和功能,采用PCR(聚合酶链式反应)、双酶切和细胞转化等基因工程方法对磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因进行克隆并使用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳进行表达分析,扩增出一个新的大肠杆菌磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因,将其基因克隆到原核表达载体pET-30a上,并导入到大肠杆菌表达菌株BL21(DE3)中。通过IPTG诱导成功表达出大肠杆菌的磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶。所提出的方法能够高效表达磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶,为进一步大规模表达纯化和应用提供参考。
  关键词:基因工程;大肠杆菌;磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶;基因表达;二氧化碳
  中图分类号:Q812文献标志码:A
  Abstract:In order to better study the structure and function of phosphoenolpyruvate carboxylase, the phosphoenolpyruvate carboxylase gene is cloned and expressed by PCR (polymerase chain reaction), double enzyme digestion and cell transformation. The results show that the new phosphoenolpyruvate carboxylase gene of Escherichia coli is successfully amplified and cloned into the prokaryotic expression vector pET-30a, and then introduced into Escherichia coli BL21 expression system. The phosphoenolpyruvate carboxylase of Escherichia coli is successfully induced by IPTG. The phosphoenolpyruvate carboxylase can be efficiently expressed by using the proposed method, which provides preparation for further scale expression, purification and application.
  Keywords:genetic engineering; Escherichia coli; phosphoenolpyruvate carboxykinase; protein expression; CO2
  磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)是一种存在于磷酸烯醇式丙酮酸和二氧化碳反应生成草酰乙酸过程中的催化酶[1-3]。PEPC酶在Mg2+和HCO-3存在的情况下催化磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)不可逆的β-羧化生成草酰乙酸(OAA)和无机磷酸(Pi)[4-5]。
  磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶广泛存在于植物和细菌中,而动物和丝状霉菌中缺少这种酶。磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶属于变构酶,主要功能为三羧酸循环提供草酰乙酸,另外也与C4植物光合二氧化碳固定反应(C4二羧酸循环)及景天科植物的苹果酸形成(景天酸代谢)等有关[6]。非光合型PEPC酶参与四碳酸的回补代谢途径[7]。植物PEPC的生理作用还包括:种子萌发和形成[8]、调节保卫细胞[9]、促进苹果酸的合成为固氮根瘤菌提供呼吸基质[10],并且在植物抗生物和非生物胁迫中有重要作用[11]。
  此外,PEPC酶参与NADPH代谢、C-N的交互反应、CO2的重吸收、苹果酸发酵和pH调节等众多重要的生理过程[12]。磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶分子的二级结构主要以β桶型结构、α螺旋为主,还有少量的β链[13-14]。它的4个亚基是以同构方式结合,其四级结构属于D2对称性,在空间上可能排列成拟四面体[15]。通常植物PEPC的氨基酸序列具有高度的保守型[16],残基数一般为960~970[17],在N末端附近有磷酸化位点(E/DR/KxxSIDAQL/MR)是植物特有的结构[18]。位于C端的963QNTG966基序与PEPC催化活性有关[19]。
  为了更好地研究PEPC酶的结构和功能的特征,本研究克隆了大肠杆菌的PEPC基因的序列并进行了诱导表达,旨在为PEPC酶结构和功能的研究提供一定的信息。
  1材料与方法
  1.1材料
  原核表达载体pET-30a由河北科技大学周晓辉教授馈赠,大肠杆菌JM109,DH5α,BL21(DE3)购自北京天根生物科技有限公司。
  1.2方法
  1.2.1PCR扩增
  大肠杆菌JM109基因组DNA提取的方法按照细菌基因组DNA提取试剂盒的说明书(北京天根)进行。按照从National Center for Biotechnology Information (NCBI)上检索到的大肠杆菌pepc基因序列的ORF使用Prime primer 5.0设计上、下游引物,分别加入Bam HI(GGATCC)和Hind III(AAGCTT)限制性内切酶的酶切位点,引物由上海英潍捷基公司合成,具体序列如下:
  上游引物:5’-CGCGGATCCATGCGCGTTAACAATGGTTTGAC-3’。
  下游引物:5’-GGCAAGCTTTTACAGTTTCGGACCAGCCGCTAC-3’。
  以大肠杆菌基因组DNA为模板在Gene Amp PCR system 9700进行PCR 反应扩增pepc基因序列,PCR 反应条件:94 ℃ 5 min;94 ℃ 45 s,60 ℃ 45 s,72 ℃ 2 min,循环35 次;72 ℃延伸10 min。PCR产物经1%的琼脂糖凝胶电泳检测确认后使用胶回收试剂盒(北京全式金)回收,送交测序公司(上海英潍捷基)测序[20]。   1.2.2重組表达载体pET-30a-pepc的构建
  pET-30a质粒的提取按照质粒提取试剂盒(GenStar BioSolutions)的说明书进行。质粒提取完毕之后,进行琼脂糖凝胶电泳检测。pepc基因扩增产物的回收产物和pET-30a质粒分别用Bam HI和Hind III(TAKARA)进行双酶切,pET-30a质粒经双酶切后要用去磷酸化酶(New England Biolabs)处理,酶切反应和去磷酸化反应后均用胶回收试剂盒(北京全式金)进行回收。经过双酶切处理的基因和载体,用T4DNA连接酶(TAKARA)连接。连接好的重组体使用热激的方法转入大肠杆菌DH5α,利用PCR技术和双酶切技术进行验证,进而将验证正确的送交测序公司(上海英潍捷基)测序进行鉴定。
  1.2.3PEPC酶的表达
  将测序成功的重组质粒转化到大肠杆菌BL21(DE3)中,获得pET-30a-pepc-BL21重组菌株。将过夜培养的pET-30a-pepc-BL21菌液,按2%接种量,依次转接于9瓶50 mL的LB(100 μg/mL Kan)液体培养基中,160 r/min,37 ℃培养。至OD600 nm为0.4~0.6,加入终浓度依次为0,0.01,0.5 mmol/L的IPTG诱导剂,37 ℃时诱图1大肠杆菌基因组DNA电泳鉴定
  Fig1Gel analysis of genome DNA from
  Escherichia coli.导3~4 h,OD600 nm值到2.0左右。8 000 r/min,4 ℃离心15 min。用细胞悬浮液重新悬浮上述离心后的菌体沉淀,加入终浓度为0.1 mmol/L PMSF和一片蛋白酶抑制剂。使用超声波细胞破碎机(宁波新芝)进行细胞破碎(破碎10 min,其中工作3 s间隔5 s),进而用超速冷冻离心机(Beckman Coulter)14 000 r/min,4 ℃离心30 min,取上清液。分别取各组的上清液,制备样品,用SDS-PAGE鉴定蛋白的表达情况。
  2结果与分析
  2.1大肠杆菌pepc基因的克隆
  2.1.1大肠杆菌基因组DNA的提取
  按照细菌基因组DNA提取试剂盒所提供的提取方法提取大肠杆菌JM109的基因组DNA,并用琼脂糖凝胶电泳检测提取结果,如图1所示。结果显示出现了目的条带,且该条带的大小比DNA Marker的最大条带要大得多,说明基因组提取成功。
  2.1.2pepc基因的PCR扩增
  以大肠杆菌基因组DNA为模板,利用上、下游引物克隆pepc基因,用琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物,结果显示在1 600 bp左右出现了条带,并且条带单一,大小与理论值相符,结果见图2所示,说明引物设计正确,目的基因扩增成功。
  2.1.3重组表达载体pET-30a-pepc
  将pepc基因和pET-30a质粒分别经Bam HI和Hind III酶切,然后在T4 DNA连接酶的作用下,将酶切产物连接成为重组质粒pET-30a-pepc,用琼脂糖凝胶电泳检测连接结果,如图3所示。结果显示重组质粒的大小明显比空载的pET-30a大,说明目的基因成功连接到载体pET-30a上。
  2.1.4双酶切验证
  提取重组质粒pET-30a-pepc,并将质粒进行双酶切验证,结果为酶切后的混合物内含有与目的基因大小一致的片段,表明pepc基因成功插入pET-30a质粒,电泳结果与预期结果相符,如图4所示。
  2.1.5重组质粒的测序验证
  将双酶切验证正确的质粒,送交测序公司测定碱基序列,并与NCBI上的pepc基因的测序结果比对,其比对结果为99%,如图 5所示,即重组质粒构建成功,该基因编码完整的磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶。
  2.2重组表达载体pET-30a-pepc在大肠杆菌中的表达
  用15%的SDS-PAGE验证表达结果。由图6可知,在66.2 kDa附件出现一条明显的条带,与理论值66 kDa相符,说明该蛋白能够单独表达,IPTG浓度高蛋白表达量也高。
  3结论
  1) 利用基因工程的技术和方法成功克隆到新的大肠杆菌磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶,并且成功构建了表达菌株。接种量的多少直接影响菌种的生长情况,通过对表达菌株的生长曲线进行测定,经过优化确定了2%的接种量最合适,为大规模的培养磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的基因工程菌株提供了数据参考。
  2) IPTG的浓度对基因的表达效果和蛋白质的最终浓度,通过添加不同浓度的IPTG,确定了最佳诱导浓度。
  3) 建立的方法确实能够高效表达磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶,如何更大规模地表达该酶是今后需要进一步关注的重点。
  参考文献/References:
  [1]GOWIK U, WESTHOFF P. C4-phosphoenolpyruvate Carboxylase[M].Netherlands:Springer, 2011:257-275.
  [2]CHRISTIN P A, PETITPIERRE B, SALAMIN N, et al. Evolution of C4 phosphoenolpyruvate carboxykinase in grasses, from genotype to phenotype[J]. Molecular Biology and Evolution, 2009, 26(2): 357-365.
  [3]GEHRIG H, TAYBI T, KLUGE M, et al. Identification of multiple PEPC isogenes in leaves of the facultative crassulacean acid metabolism(CAM) plant Kalanchoe blossfeldiana Poelln. cv. Tom Thumb[J]. FEBS Letters, 1995, 377(3):399-402.   [4]UHRIG R G, O’LEARY B, SPANG H E, et al. Coimmunopurification of phosphorylated bacterial-and plant-type phosphoenolpyruvate carboxylases with the plastidial pyruvate dehydrogenase complex from developing castor oil seeds[J]. Plant Physiology, 2008, 146(3):1346-1357.
  [5]O’LEARY B, RAO S K, KIM J, et al. Bacterial-type phosphoenolpyruvate carboxylase(PEPC)functions as a catalytic and regulatory subunit of the novel class-2 PEPC complex of vascular plants[J]. Journal of Biological Chemistry, 2009, 284(37):24797-24805.
  [6]IZUI K, MATSUMURA H, FURUMOTO T, et al. Phosphoenolpyruvate carboxylase:A new era of structural biology[J]. Annu Rev Plant Biol, 2004, 55:69-84.
  [7]NUNES-NESI A, FERNIE A R, STITT M. Metabolic and signaling aspects underpinning the regulation of plant carbon nitrogeninteractions[J]. Molecular Plant, 2010, 3(6):973-996.
  [8]O’LEARY B, FEDOSEJEVS E T, HILL A T, et al. Tissue- specific expression and post- translational modifications of plant- and bacterial- type phosphoenolpyruvate carboxylase isozymes of the castor oil plant, Ricinus communis L [J]. Journal of Experimental Botany, 2011, 62(15): 5485-5495.
  [9]COUSINS A B, BAROLI I, BADGER M R, et al. The role of phosphoenolpyruvate carboxylase during C4 photosynthetic isotope exchange and stomatal conductance [J]. Plant Physiology, 2007, 145(3): 1006- 1017.
  [10]NOMURA M, MAI H T, FUJII M, et al. Phosphoenolpyruvate carboxylase plays a crucial role in limiting nitrogen fixation in Lotus japonicus nodules [J]. Plant & Cell Physiology, 2006, 47(5): 613- 621.
  [11]CHENG G, WANG L, LAN H. Cloning of PEPC-1 from a C4 halophyte Suaeda aralocaspica without Kranz anatomy and its recombinant enzymatic activity in responses to abiotic stresses [J]. Enzyme and Microbial Technology, 2016(83): 57- 67.
  [12]BRENDAN O L, JOONHO P, WILLIAM C P. The remarkable diversity of plant PEPC(phosphoenolpyruvate carboxylase):Recent insightsinto the physiological functions and post-translational controls ofnon-photosynthetic PEPCs[J]. Biochemical Journal, 2011, 436(1):15-34.
  [13]MATSUMURA H X Y, SHIRAKATA S. Crystal structures of C4 form maize and auaternary complex of E. coli phosphoenolpyruvate carboxylases[J]. Structure, 2002, 10(12): 1721- 1730.
  [14]王岳坤,陽江华. 橡胶树磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因Hb PPC1 的克隆和表达分析[J]. 热带作物学报,2015,36(5):895-900.
  WANG Yuekun, YANG Jianghua. Cloning and expression analysis of phosphoenolpyruvate carboxylase gene Hb PPC1 from hevea brasiliensis[J]. Chinese Journal of Tropical Crops,2015,36(5):895-900.   [15]魏绍巍, 黎茵. 植物磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的功能及其在基因工程中的应用[J]. 生物工程学报, 2011, 27(12): 1702-1710.
  WEI Shaowei, LI Yin. Functions of plant phosphoenolpyruvate carboxylase and its applications for genetic engineering[J]. Chin J Biotech, 2011, 27(12): 1702-1710.
  [16]KAI Y M H, INOUE T, TERADA K,et al. Three dimensional structure of phosphoenolpyruvate carboxylase: A proposed mechanism for the allosteric inhibition[J]. Pro Natl Acad Sci,1999(96): 823- 828.
  [17]SHYLAJANACIYAR M, DINESHBABU G, RAJALAKSHMI R, et al. Analysis and elucidation of phosphoenolpyruvate carboxylase in cyanobacteria [J]. The Protein Journal, 2015, 34(1): 73- 81.
  [18]RUIZ-BALLESTA I, FERIA A B, NI H, et al. In vivo monoubiquitination of anaplerotic phosphoenolpyruvate carboxylase occurs at Lys624 in germinating sorghum seeds [J]. Journal of Experimental Botany, 2014, 65 (2): 443- 451.
  [19]ALVAREZ R, GARCA-MAURI O S, FERIA A B, et al. A conserved 19-amino acid synthetic peptide from the carboxy terminus of phosphoenolpyruvate carboxylase inhibits the in vitro phosphorylation of the enzyme by the calcium-independent phosphoenolpyruvate carboxylase kinase [J]. Plant Physiology,2003, 132(2): 1097- 1106.
  [20]HE X, ZHOU X, YANG Z, et al. Cloning, expression and purification of d-tagatose 3-epimerase gene from Escherichia coli JM109[J]. Protein Expression & Purification, 2015, 114(2):77-81.第40卷第2期河北科技大學学报Vol.40,No.2
其他文献
摘 要:作為网络物理空间CPS(cyber-physical space)建设的重要支撑技术之一,数字孪生已应用在航空航天、智能制造、智慧城市、智慧医疗、智慧教育等多领域,但其在实践过程中也出现了一些问题。例如:数字孪生概念泛化,导致理解偏差从而造成产学研用目标不一致、实践结果不受目标用户认同;具体实施缺乏通用有效方法,导致难以形成普遍性实践案例和公认的典型案例。为解决这些问题,需对数字孪生概念边
期刊
摘要:当前,中国就业形势十分严峻。影响劳动者就业的原因之一,是劳动者自身的就业质量有待提升。因此,要加大人力资本投资,改善教育培训模式,加强职业培训,提高劳动者就业能力。同时要加速增长模式转型和产业结构升级,提高劳动者收入;改善企业用工模式,提高劳动者就业稳定性;推进体制改革和制度创新,依法规范劳动用工行为,实现平等就业。  关键词:劳动者;劳动就业;就业权益;就业质量  中图分类号:F241.4
期刊
摘要:西柏坡时期是中国革命取得胜利的最后关头,军事战争成为国共双方进行较量并决定中国前途命运的最重要途径和手段。整个西柏坡时期的军事历程可归纳为战略防御、战略进攻、战略决战、战略收官四个阶段,在每个战略阶段部署和实践中,中国共产党人都鲜明地凸显出了“敢于斗争,敢于胜利”的精神特质,并最终将中国革命推向属于人民的胜利。  关键词:西柏坡精神;军事斗争;战略部署;三大战役;战略收官  中图分类号:D2
期刊
摘要:从五大发展理念出发,科学界定县域经济高质量发展的内涵,构建评价指标体系,运用熵权法和国际竞争力法评价县域经济高质量发展,并以河北省118个县(市)的数据为样本,对其高质量发展水平进行测度,把118个县的各指标进行排名,并按照综合指标排名,将其划分为三个层次。最后分类施策,从科技创新、结构优化、绿色环保、开放互通、公共服务五个方面,提出对三个不同层次的县域经济发展的政策建议。  关键词:县域经
期刊
摘要:欧盟、东盟以及北美自由贸易区的建立均是为了推动地区的和平与稳定。但是,英国脱欧说明,构建区域共同体在现实中仍然面临着诸多问题和挑战,最根本的原因在于地区经济发展水平和市民意识的差距,为此,形成教育共同体就显得十分重要。  关键词:全球化;东亚地区;教育共同体;教育协调计划;教育网络  中图分类号:G526.9 文献标识码:A 文章编号:1673-1573(2019)02-0071-04 
期刊
摘要:作为2018年的年度词汇,“锦鲤”在社交网络上受到了广大网民的追捧。通过分析“锦鲤”现象的成因和公众“转发锦鲤”行为产生的心理机制对这一传播现象进行考察。研究认为,“转发锦鲤”行为的心理基点在于人们对于美好生活的向往和对生活压力的拒斥。同时,随着后现代文化的兴起,宏大叙事的逐渐衰落拉近了人们同信仰对象的距离,“锦鲤”文化便是由此衍生出的一种表现形式。资本的推动和对“锦鲤”形象的构造也在“锦鲤
期刊
摘要:中华传统文化博大精深,蕴含着丰富的民族文化精髓和人文精神,是文化传承与民族复兴重要的精神保障。“大学语文”课程承载着培养大学生人格精神和弘扬优秀传统文化的重大使命。把中华优秀传统文化教育融入到大学语文课程建设对提高和丰富学生的文化内涵及传统民族文化素养大有裨益。为此,改进《大学语文》课程应从改善教学模式、提高课堂学习效率,注重实践拓展、营造浓郁的传统文化氛围和加大资金投入、充实教师队伍着手。
期刊
摘要:以CSSCI数据库中的期刊数据为基础,利用知识图谱绘制软件CiteSpace Ⅱ对1999—2018年间发表的关于知识服务的科学文献进行了可视化分析。对分析结果进行解读发现,知识服务研究不断发展,所涉及学科交叉范围广泛,其中图书馆是该领域研究的热门主题,图书馆学与情报学学者是相关研究的主要力量。近年来,知识服务研究受技术的影响不断加深,研究热点逐渐变为与数字出版、大数据等方向的结合研究。  
期刊
摘要:作为《红楼梦》重要女主人公之一的薛宝钗,其身上笼罩着许多谜团。通过详细分析曹公原文和脂批,解读其进京确实是为了参加“选秀”的目的及选秀失利之谜;在无缘宫闱后,薛宝钗默认了元妃的指婚,逐渐对宝玉产生了爱情,并步入了短暂的琴瑟相合的婚姻生活,但却又因其早年埋在宝玉心中的“禅机”和当下那一番番“立身扬名”的说教,使得宝玉最终弃她而去,落得个空闺独守、终身寂寞的悲剧人生。  关键词:《红楼梦》;薛宝
期刊
摘要:基于2003—2016年中国城市面板数据,实证研究相关多样化、不相关多样化对城市服务业就业的影响。在分析过程中,运用不同地区和不同人口规模的城市所具有的异质性考察相关多样化、不相关多样化对城市服务业就业影响的差异性。研究显示:总体来看,产业不相关多样化促进了城市服务业就业的增长,相关多样化则对城市服务业就业具有抑制作用;从分地区和分城市规模来看,不相关多样化对城市服务业就业具有促进作用,而相
期刊