目的分析预测核心配伍药(黄芪-当归-白芍-甘草)改善类风湿性关节炎(RA)骨破坏的作用机制。方法首先在《中药大辞典》中检索核心中药的所有化学成分;其次采用中药系统药理学数据库(TCMSP)中的ADME参数,遴选活性成分;然后在Pub Chem和TCMSP数据库中查找活性成分对应的人类靶蛋白,在Gene数据库中查找RA骨破坏的相关基因;把靶蛋白和基因导入分子网络分析平台,采用核心计算分析法则,分别构建药物和疾病的分子网络和生物学通路,并进行比较映射分析。结果在与RA骨破坏关联度较高的生物通路中,核心配伍药靶蛋白主要参与了细胞免疫相关通路、细胞生长增殖相关通路及核受体相关通路。作用位点为toll样受体2(Toll-like receptor 2,TLR2)、过氧化体增殖物激活型受体(Peroxisome Proliferator Activated Receptors,PPARs)、去整合素金属蛋白酶(a disintegrin and metalloproteinase,ADAM17)、热休克蛋白90(heat shock protein90,HSP90)、细胞色素P450酶(cytochrome p450)。结论黄芪-白芍-当归-甘草配伍可能通过影响上述作用靶点,以及调控细胞免疫等信号通路,抑制炎症反应,调节破骨细胞免疫功能和机体代谢功能,从而改善RA骨破坏的发病。