南海独一无二的战略地位和其蕴藏丰富的自然资源使该地从20世纪70年代开始局部利益冲突不断,特别是南海仲裁结果的公布更加剧了该地局势的严峻性;然而南海水域蕴含的水下文化遗产又为地区和平稳定、合作发展带来新途径。目前,南海水下文化遗产遭受的破坏性打捞和非法拍卖的危险无法通过现有各国国内法律和国际公约解决,再加上地区争端实际阻滞了临海国行使水下文化遗产的管辖权,这些都使得寻求跨国合作保护南海水下文化遗产成为必然。确立南海水下文化遗产合作机制不仅有益于保护起源我国但沉没于他国管辖海域内的水下文化遗产,也是南海诸国文化遗产保护的共同需求。这不仅是我国行使文化主权从而为我国捍卫南海主权寻求有力佐证,更是我国实施"一带一路"以及"南海行为准则"的具体措施。通过建立不同层递的合作来循次渐进的构建南海水下文化遗产跨国保护机制,应从水下文化遗产技术合作,数据库共享,到水下文化遗产报告预警系统的建立,最终构建水下文化遗产协调国保护制度。