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皇藏峪有野生种子植物９０科、３２８属、５６３种。属的地理成分复杂，但以温带成分占明显优势，反映了该区植物区系的温带属性。其科、属均以极小和小为主，说明了区系成分的多样性。植物分布呈现南北植物的交汇渗透，具有显著的过渡性。根据对２４个样地的分析，将该区的森林植被划分为１个植被型，７个群系。并对各个群系的主要群落学特征进行了描述。