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新形势下,地方高校的科研管理面临诸多困境,主要表现在科研管理价值取向过于功利化、科研管理职能定位不准、科研管理机制未能与时俱进、科研管理方式较为机械刚性、科研管理队伍素质有待提高等方面。地方高校科研管理者应从抑制功利化的价值取向、科学定位科研管理职能、创新科研管理机制、实行刚柔相济的管理方式、加强科研管理队伍建设等方面,积极探寻走出困境的出路。