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新疆凌云铜矿大地构造位置属塔里木板块北缘活动带之南天山晚古生代弧后盆地．由于受区域构造影响，南天山形成一系列近EW向韧-脆性断裂带及剪切褶皱，伴随强烈的岩浆活动，为铜的活化、富集提供了有利条件．铜矿化带赋存于中泥盆统萨阿尔明组第二岩性段一套灰绿色富钠质海相火山岩-角斑岩系中，构造变形表现形式为脆-韧性剪切带及其紧闭褶皱，变质作用为低绿片岩相区域低温动力变质．