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利用基因表达谱数据,通过计算互作蛋白质的表达相关系数,来筛选、优化蛋白质互作网络。结果显示,利用经过筛选的互作数据,根据邻居计数法和卡方法进行功能预测的预测效果明显提高,距离待测蛋白质较远的邻居也包含着与待测蛋白质功能一致的信息。
根据基因表达谱筛选间接互作蛋白质进行蛋白质功能预测
【摘 要】
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利用基因表达谱数据,通过计算互作蛋白质的表达相关系数,来筛选、优化蛋白质互作网络。结果显示,利用经过筛选的互作数据,根据邻居计数法和卡方法进行功能预测的预测效果明显
【机 构】
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哈尔滨医科大学生物信息学系,同济大学生命科学与技术学院
【出 处】
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生物信息学
【发表日期】
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2006年03期
【基金项目】
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国家自然科学基金(30370798,30170515,30370388)资助项目;国家863计划(2003AA2Z2051;2002AA2Z2052)资助项目;黑龙江科技攻关重点(GB03C602-4)资助项目;哈尔滨市科技攻关(2003AA3CS113)资助项目;黑龙江自然科学基金(F0177)资助项目;哈医大211工程“十五”建设项目
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