【摘 要】
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以粗粒化的多肽链模型进行了SARS病毒包膜中E蛋白的计算机模拟, 描述了该蛋白质空间构象的概貌.首先扩展了多肽链的HP模型, 使之能够用于研究在水或脂环境下蛋白质折叠的行为
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以粗粒化的多肽链模型进行了SARS病毒包膜中E蛋白的计算机模拟, 描述了该蛋白质空间构象的概貌.首先扩展了多肽链的HP模型, 使之能够用于研究在水或脂环境下蛋白质折叠的行为, 并且考虑了全部氨基酸残基疏水相互作用能的差异.相关格子链的Monte Carlo模拟显示了很高的计算效率.模拟再现了蛋白质的coil-globule转变, 验证了蛋白质序列分布的重要性.结果表明, 在水环境中, E蛋白质空间结构由紧致的疏水内核和部分向外延伸的亲水片段组成; 在脂环境中, 中部疏水片段会成为向外延伸的环, 而当两侧紧
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