[目的/意义]农业合作曾是琼台经贸合作的先行课题,在两岸关系趋于复杂和海南全岛建设自由贸易港背景下,对琼台农业合作研究进行历程回顾和热点分析,有助于正确认识和应对新形势下琼台农业合作的机遇与挑战.[方法/过程]运用文献研究法,基于CNKI的文献计量分析和主题聚类,对琼台农业合作研究历程、热点主题和趋势进行了全面梳理.[结果/结论]琼台农业合作研究紧贴实践,在时代裹挟下走过了农业项下的自由贸易、国际旅游岛背景下的农业合作、自由贸易港背景下的农业合作3个阶段.而琼台农业比较及合作前景分析、观光休闲农业、台商对琼农业投资、台资农业企业集聚发展是4个热点主题.未来,立足琼台农业合作现状,着眼海南自贸港建设新形势,对照国内外实践和研究进程,应该坚持理论性研究与应用性研究并重、定性研究与定量研究并用、跨学科与跨区域并举的发展思路.