【摘 要】
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目的 应用多位点可变数目串联重复序列基因分型方法,对新疆维吾尔自治区(新疆)4个类型鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)分离株进行基因分型研究,探析新疆分离株与我国其他鼠疫疫源地分离株之间的遗传进化关系.方法 收集2015-2019年新疆4个类型鼠疫自然疫源地18株分离株,提取鼠疫菌基因组DNA,采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)(14+12 VNTR位点)技术、多色毛细管电泳方法进行基因分型,运用BioNumerics 7.6软件对基因分型结果进行聚类分析.结果 18株鼠疫分离株被14位点M
【机 构】
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新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心应急鼠防所,新疆乌鲁木齐830001;新疆维吾尔自治区人民医院,新疆乌鲁木齐830001
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目的 应用多位点可变数目串联重复序列基因分型方法,对新疆维吾尔自治区(新疆)4个类型鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)分离株进行基因分型研究,探析新疆分离株与我国其他鼠疫疫源地分离株之间的遗传进化关系.方法 收集2015-2019年新疆4个类型鼠疫自然疫源地18株分离株,提取鼠疫菌基因组DNA,采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)(14+12 VNTR位点)技术、多色毛细管电泳方法进行基因分型,运用BioNumerics 7.6软件对基因分型结果进行聚类分析.结果 18株鼠疫分离株被14位点MLVA分为3个群、12个基因型;被14+12位点MLVA分为3个群、15个基因型,且同类型鼠疫自然疫源地分离株聚为一个分支.不同时期、同类型鼠疫自然疫源地的分离株亲缘关系较近,基因型存在明显的地区聚集性,遗传性相对稳定.结论 新疆4个类型鼠疫自然疫源地分离株基因型呈多态性,遗传性相对稳定;MLVA分型方法适宜新疆鼠疫分离株遗传进化与溯源研究.
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