【摘 要】
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目的探究炎症性肠病相关结直肠癌发生发展过程中的基因调控机制。方法提取GEO数据库GSE6731(炎症性肠病芯片)、GSE21250(结直肠癌芯片)数据集,采用R语言分别获取炎症性肠病与
【基金项目】
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浦东新区科技发展基金资助项目（No.PKJ2018-Y36）;复旦大学附属浦东医院浦菁计划资助项目（No.PJ201502)
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目的探究炎症性肠病相关结直肠癌发生发展过程中的基因调控机制。方法提取GEO数据库GSE6731(炎症性肠病芯片)、GSE21250(结直肠癌芯片)数据集,采用R语言分别获取炎症性肠病与结直肠癌相对于健康对照人群的差异表达基因。取两组差异基因交集定义为炎症性肠病诱导结直肠癌的风险基因,进一步进行功能富集分析,并绘制蛋白互作网络。随后基于TCGA数据库,利用GEPIA网页工具分析风险基因与结直肠癌患者生存期的关系,利用LinkedOmics工具分析风险基因在TNM各子集的表达水平。通过蛋白质免疫印迹(West
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