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HIV—1是以范围较宽的遗传多相性为特征的。至少有9种亚型(A~H和O),A、C、D亚型常见于非洲,E亚型主要分布在泰国。B亚型病毒主要流行在欧洲和美国,使绝大多数的资源用于这种亚型的疫苗开发,令人担心的是这些疫苗产品不能产生广泛的足够的免疫性去防止其他亚型在世界范围的感染。国际性的HIV—1亚型的广泛传播和日常的国际旅游业最终会使其他亚型在美国传播开来。至今仅有1名非B亚型病毒在美国