很多人之所以反对发掘乾陵，主要原因是认为目前国内的科学技术水平还不足以对挖掘现场及出土文物进行妥善保护。不仅在中国，文物的“永久性”保护是一个世界性难题。反对开掘乾陵者经常引用以下几个令人痛心的例子。
　　明朝万历皇帝尸骨1958年9月6日，新华社向世界播发了一条消息“明十三陵中的定陵已被打开。陵墓是一座地下宫殿，全部用大块青白石砌成的拱券，有两层楼高、八十多公尺长。在后殿里放着三口一人多高的朱红色棺材，明朝第十三个皇帝朱翊钧和他的两个皇后都躺在里面。尸体己腐烂，骨架完好，头发软而有光……”然而8年之后，“文革”期间，在“打倒地主阶级的头子万历”的口号声中，万历皇帝及皇后的尸骨被红卫兵小将们从文物仓库中揪出并接受批斗，之后被砸烂，继而点火焚毁……在定陵出土的大量文物都没能保存下来。此后，我国再也没有批准过对帝王陵进行发掘。
　　马王堆汉墓出土文物　1972年至1974年，长沙马王堆汉墓发掘出土了5000多件珍贵文物和一具保存完好的女尸。在出土的一个漆器里面，人们惊奇地发现了几片藕片。历经2100年，藕片依然清晰可辨。但是，就在摄影师调焦距准备照相的时候，转瞬间藕片化而为水，再也无法复原。马王堆汉墓女尸出土后用专门的设备进行保护，但还是进行了解剖处理。另一件稀世珍宝——“素纱禅衣”现在在衣领和袖口处都出现了破痕。
　　秦始皇兵马俑 秦始皇兵马俑最初发掘出来时都是彩色的，但不久即被氧化变成黑色。不仅褪色，兵马俑还大面积遭受真菌侵扰。外国专家经分析后指出，每年人数高达150万的游客是兵马俑遭毁坏的祸首之一。我国专家也指出，如果还不采取措施加以保护，那么在100年内兵马俑将遭到严重腐蚀，兵马俑坑看上去将与煤田没有什么两样。