【摘 要】
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目的探究SNHG11在结直肠癌中的表达与临床病理之间的关系,并预测SNHG11参与结直肠癌发生发展的机制。方法从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)下载结直肠癌临床
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目的探究SNHG11在结直肠癌中的表达与临床病理之间的关系,并预测SNHG11参与结直肠癌发生发展的机制。方法从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)下载结直肠癌临床病理及基因表达谱信息。通过HGNC(HUGO gene nomenclature committee,HGNC)中长链非编码RNA(lnc RNA)数据库选出差异表达的lnc RNA分析,通过cBio Portal for Cancer Genomics网站对差异基因进行表达量的变化,分析SNHG11在结直肠癌中的表达情况,并探讨SNHG11表达和临床病理学参数的相关性。采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法预测SNHG11可能参与的代谢通路。结果 SNHG11的表达水平与结直肠癌T分期(P=0.028)、淋巴结转移(P=0.005)、远处转移(P=0.000)及TNM分期(P=0.001)显著相关。SNHG11高表达癌症样本显著富集到RNA聚合酶、RNA降解、前体RNA剪切、嘧啶代谢等相关基因集。结论 SNHG11可能通过调RNA合成,前体RNA的剪切等过程,从而参与了结直肠癌的发生与发展。
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