不同疫源地鼠疫宿主动物的DNA条形码比较研究

来源 :中华地方病学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cbiba123
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目的

评估应用DNA条形码技术鉴定不同地理区域物种的可行性。

方法

选取内蒙古自治区3个鼠疫自然疫源地4种鼠疫宿主动物的DNA条形码进行比较,分析GC碱基含量和密码子偏好性、计算遗传距离,采用邻接法(NJ)构建分析系统发育树。

结果

不同疫源地的五趾跳鼠GC碱基含量比较差异有统计学意义(F= 5.34,P < 0.05),长爪沙鼠疫源地五趾跳鼠的GC碱基含量变异较大,与其他疫源地五趾跳鼠比较差异均有统计学意义(P均< 0.05)。不同疫源地间同一鼠种很少存在种内密码子变异位点;各鼠种种内平均遗传距离均< 1%,种间遗传距离均> 18%。

结论

各鼠种DNA条形码具有特异性,不存在物种间共享,不因地理位置变化而改变。利用DNA条形码可以达到鼠疫宿主动物分子鉴定的目的。

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