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上海光源直线加速器采用一个次谐波聚束腔组成预注入器，其性能的稳定性和可靠性直接关系到电子束流的品质。二次电子倍增效应是其不稳定性的原因之一，为考察其中的二次电子倍增效应，将上海光源次谐波聚束腔与最普通的重入式谐振腔进行对比。结果表明，在实际使用的工作范围内，优化次谐波腔形状可有效抑制其中的二次电子倍增效应。进一步的考察表明，腔体结构的圆滑设计是抑制二次电子倍增的原因。