【摘 要】
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目的改进标准遗传算法以提高蛋白质结构的预测效率。方法在标准遗传算法的基础上引入蒙特卡罗局部优化策略、克隆体过滤策略、多胎竞争选择策略等,在均匀变异的基础上,引入一
【机 构】
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广东医学院物理学教研室,广东医学院生理科学实验室
【基金项目】
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湛江市科技计划项目(No.2006C10012)
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目的改进标准遗传算法以提高蛋白质结构的预测效率。方法在标准遗传算法的基础上引入蒙特卡罗局部优化策略、克隆体过滤策略、多胎竞争选择策略等,在均匀变异的基础上,引入一系列结构突变算子。利用改进的遗传算法对标准蛋白质序列进行二维折叠模拟。结果与其他算法相比,利用改进的遗传算法搜索到了HP60和HP64序列能量更低的构型。结论引入的遗传策略和突变算子增强了遗传算法的寻优能力。改进的遗传算法是个极具潜力的蛋白质结构预测方法。
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