HP模型相关论文
生物信息学是在生命科学的研究中,以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。从信息学角度来看,生物分子是生物信息的载......
蛋白质的天然构象是由其氨基酸序列确定的,而蛋白质的生物学功能在很大程度上又依赖于其构象,因此蛋白质构象预测是蛋白质研究中发展......
蛋白质结构预测是生物信息学研究领域的热点问题之一,它是关于如何从蛋白质的氨基酸序列出发来预测它的结构、折叠、功能等问题.本......
蛋白质结构是生物信息学的重要研究问题之一,尤其是研究怎样从已测得的一级结构和α-螺旋,β-折叠等部件线性构成的二级结构得出空间......
本文应用计算机模拟方法对蛋白质折叠结构进行分析,研究了在二维的HP模型下,采用Monte—Cado算法,运用F—P法、K—D法、沃氏法、埃氏......
遗传算法和蚁群算法在HP模型中已经有了大量的研究及成果,蚁群算法具有分布式并行全局搜索能力.通过信息素的积累和更新收敛于最优路......
蛋白质折叠的格点HP模型是Dill等人八十年代末提出的。本文根据链的结点数确定折叠后结构,给出了一种求解蛋白质结构问题的三维HP......
构造了一个新的数学模型,把三维HP模型的蛋白质折叠问题由一个有约束的优化问题转化为无约束的优化问题,通过建立相对坐标和邻域结构......
氨基酸的亲疏水格点模型是研究蛋白质折叠的一种重要的简化模型,其优化问题是一个非确定型的多项式问题.采用蚂蚁群落优化算法对这......
蛋白质折叠问题就是从氨基酸序列中预测蛋白质的构象,该问题是生物信息学的一个突出问题。主要研究二维HP格点模型,它是用于模拟蛋......
采用标准化氨基酸疏水性指数将7种Caerins的氨基酸序列转换为28种疏水性(H)或极性(P)的序列,通过二维疏水性–极性(HP)模型分析其......
任何连通的带权图均有TSP的解.本文用图的最短路径矩阵代替加权邻接矩阵,使所有带权图,HP模型都能够接受.由于采用并行算法,可以较快获得问题......
<正>It is important to know the rate of intra-molecular contact formation in proteins in order to understand how protein......
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基于蛋白质二维HP模型提出改进的遗传算法对真实蛋白质进行计算机折叠模拟。结果显示疏水能量函数最小值的蛋白质构象对应含疏水核......
对预测蛋白质空间结构的拟物算法的有效性进行理论分析,证明用该拟物算法求得合法的结构存在较大的随机性;给出折叠结构发生冲突的判......
蛋白质所具有的生物学功能取决于蛋白质的空间折叠结构,研究蛋白质的空间结构在生物学领域具有重要意义。Anfinsen等人的研究工作......
采用分子模拟方法考察表面活性剂与蛋白质分子之间的相互作用及其对蛋白质折叠过程热力学特性的影响,蛋白质分子构建采用HP模型并......
为了提高蛋白质结构预测效率,针对蛋白质HP模型折叠问题,在标准遗传算法的基础上,提出了一系列改进的搜索策略:控制群体中全同体数目,保......
为了提高蛋白质折叠结构预测的求解效率,针对2D HP格点模型,研究蚁群ACO(Ant Colony Optimization)算法在该问题上的应用。采用四......
Cannabinoid receptor Type 2(简称CB2)是大麻素受体的一种亚型,因为其无中枢神经副作用,不会产生成瘾性及耐受性,显示出了非常好......
目的改进标准遗传算法以提高蛋白质结构的预测效率。方法在标准遗传算法的基础上引入蒙特卡罗局部优化策略、克隆体过滤策略、多胎......
蛋白质结构预测是生物信息学中的重要研究方向.为了研究蛋白质折叠的机理,人们引入了只考虑蛋白质疏水核心和亲水外围位置导致能量......
蛋白质结构预测问题一直是生物信息学中的重要问题。基于疏水极性模型的蛋白质二维结构预测问题是一个典型的NP难问题。目前疏水极......