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一般的静态故障诊断模型无法描述状态随时间变化的系统，为此用隐马尔可夫模型对动态变化的系统状态进行建模，给出了动态多故障诊断问题的形式化描述；该问题的目标函数是典型的集合覆盖问题，属于NP难解问题。通过将原始目标函数转化为若干个独立的子问题，并分别用动态规划算法进行求解，有效实现了动态系统的多故障诊断；与现有的方法相比，该方法在不影响检测率和隔离率的前提下，执行时间短，计算复杂度低，优化效果明显。