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以三维地质建模理论为支撑,对水利水电工程复杂三维地质建模展开研究,讨论复杂三维地质建模如何充分利用基础勘探资料、结合多种要素控制进行精确三维地质建模,多种要素主要包括:①钻孔、平硐、槽坑探等基础勘察资料;②人工编辑的勘探剖面数据;③专家推理的辅助剖面数据;④通过数学方法形成的拟合数据等。设计符合工程施工过程的建模流程,并进行软件实现和应用。通过实际应用,该研究内容有效将专家知识更好地融入到建模过程中,提高了建模数据的精度和三维模型的精度。