川中黑山羊BMP2、BMP4基因cDNA克隆及生物信息学分析

来源 :江苏农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiangshuhua
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  摘要:参照GenBank已公布的绵羊BMP2基因序列与牛BMP4基因序列分别设计一对引物,以川中黑山羊卵巢总RNA为模板,采用RT-PCR技术扩增川中黑山羊BMP2基因和BMP4基因的cDNA序列并进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果表明,川中黑山羊BMP2基因编码区全长为1 188 bp(GenBank登录号为KF492982),BMP4基因编码区全长为1 230 bp(GenBank登录号为KF492983),分别编码395、409个氨基酸。川中黑山羊与绵羊、牛、猪、人、马、鼠、鸡BMP2基因编码区序列的同源性分别为99.7%、98.7%、92.0%、89.6%、91.4%、86.1%、78.9%;川中黑山羊与绵羊、牛、猪、人、马、鼠、鸡BMP4基因编码区序列的同源性分别为99.3%、99.1%、95.9%、95.2%、94.4%、920%、80.1%。用MEGA 4.0构建物种间分子系统进化树,结果显示,BMP2基因和BMP4基因的聚类反应基本一致,川中黑山羊首先与绵羊聚类,再分别与牛、猪、马、人和鼠聚类,最后与鸡聚类,这与动物分类学基本吻合。 全文查看链接   1.6 克隆及重组子筛选和鉴定 全文查看链接   通过在线程序TMHMM 2.0进行跨膜区分析,BMP2和BMP4 都只存在1个跨膜区,且跨膜区都位于信号肽位置,结合对信号肽的考虑可知,这2个基因编码的成熟肽都没有跨膜区。TargetP亚细胞定位预测结果显示,BMP2成熟蛋白位于细胞外的概率是0.728,BMP4蛋白位于细胞外的概率是0785。 全文查看链接   4 结论 全文查看链接
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