【摘 要】
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复杂疾病是基因与基因、基因与环境交互作用的结果,高维基因交互作用的探测给计算带来了极大的挑战。在过去20年间,机器学习方法被用于探测基因-基因交互作用,并取得了一定的
【基金项目】
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国家自然科学基金(编号:61772197,61370172)资助~~
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复杂疾病是基因与基因、基因与环境交互作用的结果,高维基因交互作用的探测给计算带来了极大的挑战。在过去20年间,机器学习方法被用于探测基因-基因交互作用,并取得了一定的效果。本文综述了机器学习方法在基因交互作用探测中的研究进展,系统地介绍了神经网络(neural networks,NN)、随机森林(random forest,RF)、支持向量机(support vector machines,SVM)和多因子降维法(multifactor dimensionality reduction,MDR)等机器学习方法在全基因组关联研究(genome wide association study,GWAS)中探测基因交互作用的原理和局限性,并对未来的研究进行了展望。
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